南湖新闻网：http://news.hzau.edu.cn/2017/0415/48862.shtml
近日，公司棉花遗传研究团队在国际学术刊物《Plant Biotechnology Journal》杂志上在线发表题为“Population structure and genetic basis of the agronomic traits of upland cotton in China revealed by a genome-wide association study using high-density SNPs”的研究论文。棉花团队黄聪博士为论文第一作者，张献龙教授和林忠旭教授为共同通讯作者。文章全面地揭示了中国国内的陆地棉种质资源的遗传结构以及重要农艺性状的遗传基础，对进一步开展棉花遗传学研究以及指导棉花改良育种具有重要意义。
棉花是最重要的纤维经济作物，该团队多年来致力于棉花的分子遗传学研究工作。此次研究广泛收集了国内503份陆地棉种质资源，利用63K棉花芯片以及所对应的高密度遗传图谱对其进行基因分型，研究发现该陆地棉群可以明显地划分为3个亚群，而且亚群的划分与地理来源和品种育成时期并没有直接的联系，推测国内各地区间存在棉花的引种及基因的交流。结合2年4点8环境的表型数据，对开花期、产量和纤维品质等共16个棉花农艺性状进行全基因组的关联分析，共检测到160个相关联的QTL以及158个候选区间，找到了一个棉花衣分相关的候选基因（Gh_D08G2376）。在检测到的25个候选区间内，找到了19个相关的已报道的棉花功能基因；通过组织表达模式分析，在86个候选区间内找到了共336个组织特异表达的基因，这些结果为后续基因挖掘及功能研究提供了重要的参考依据。此外，研究发现部分QTL能够控制多个性状，作者通过绘制网络图清晰地展示性状之间的联系及QTL的多效性。
该研究工作得到了包括中国农科院棉花研究所、新疆农垦科学院、石河子农业科学院、河南农业科学院、江苏农业科学院、山西棉花研究所、山东棉花中心、河北农业大学和黄冈师范学院等科研院所和高校的支持。
论文链接：http://onlinelibrary.wiley.com/journal/10.1111/(ISSN)1467-7652/earlyview
